Son órganos rectores de la Cofradía: la Junta General, el Cabildo y el Patrón Mayor.
La Junta General es el órgano superior de gobierno y decisión de la Cofradía, en la que están representados todos los profesionales del sector afiliados. Actúa como órgano de control y fiscalización de los restantes órganos rectores de la Cofradía.
El Cabildo es el órgano de gobierno, gestión y administración de la Cofradía. Está formado por el Patrón Mayor, el Secretario y los vocales, de los cuales dos serán obligatoriamente los vicepatrones 1º y 2º.
El Patrón Mayor es el representante de la Cofradía. Preside la Junta General y el Cabildo. Será elegido por la Junta General de entre sus miembros.
Las elecciones para la constitución o renovación de los órganos de la Cofradía de Pescadores "San Telmo" de Porto do Son se realizan cada cuatro años y se rigen por lo establecido en el DECRETO 8/2014, de 16 de enero, por el que se regulan las cofradías de pescadores de Galicia y sus federaciones, así como por los Estatutos de la propia Cofradía.
En las últimas elecciones resultó elegida la siguiente directiva:
- Patrón Mayor: Emilio Queiruga Santamaría
- Vice Patrón: Juan Ramón Torres Romero
- Vice Patrón Segundo: Fernando Queiruga Sampedro
- Secretaria: Laura Longueira Vázquez
- Vocales de la Junta General: Jesús Manuel Cervera Mendoza, Manuel Ramón Rodríguez Maneiro, Juan Carlos Santos Queiruga, Juan Torres González, Jorge Torres Torres, Luis Miguel Carballo Blanco, Juan Manuel Maneiro Quintáns, El Mostafa Akrati, Jose Antonio Sampedro Rego y Jose Antonio Queiruga Santamaría.